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Velvet 已完成測試資料(HUMEM1T主機)

Organism Number of
Library
Genome
Size(bp)
Coverage Input Data
Size(Gbase)
RAM(G) Time(Hr)  CPU*
HOUR
瘧原蟲 1 23.3M ~x95 2.2 12 0.28 17.92
瘧原蟲 2 23.3M ~x560 13 630 12.33 789.12
果蠅 2 112M ~x85 10.6 31 2.2 140.8
班馬魚 18 1.2G ~x25 30.5 312 60.27 3857.28
班馬魚 1 1.2G ~x30 35.6 371 34.6 2214.4
班馬魚 1 1.2G ~x46 55.3 787 82.25 5264

 

Velvet 消秏資源時間軸圖表

紅色:CPU, 藍色:記憶體

 

Plasmodium

 

zebrafish_18libs

 

zebrafish coverage x46

 

nrpb

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