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以單細胞RNA定序方式重建肺臟末稍上皮細胞的分化譜系--Nature

2014年4月在Nature上有一篇由史丹佛大學醫學院發表一項研究結果,以單細胞RNA定序方式,重建肺臟末稍上皮細胞的分化譜系。在研究中使用單細胞RNA定序技術,從198個不同發育階段的小鼠肺泡表皮細胞中,比較不同階段RNA的表現量後,不只能確認已知的肺泡表皮細胞分化模型,也發現了新的細胞型態標誌。這個實驗完整地重建肺泡細胞分化模型。單細胞RNA定序也可以應用於其他發育中細胞或成熟的細胞,用來分辨不同細胞種類、決定細胞譜系、或者找出各個不同階段特有的調控因子。詳細內容請參閱Nature

基因啟動子-哺乳類基因表現量的圖解--Nature
在2014年三月Nature所發表的期刊中,有一篇名為 "A promoter-level mammalian expression atlas” 為名的文章,由日本知名研究機構RIKEN所發表。他利用CAGE方法透過Heliscope定序儀找出mRNA五碳端的序列,藉此找出基因表現起始位置。在研究中透過不同組織,不同細胞,甚至不同物種,找出哺乳類中真正的例行表現基因,和它們之間特有的表現形式。在他們的註解中,甚至可以透過共同表現的關聯性預測出新的表現基因的功能。想知道更多,請參閱網址http://fantom.gsc.riken.jp/5/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=24670764


 

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