Galaxy 申請表 上下載資料 提問

 

雲端儲存之檔案上傳與下載和檔案管理

 

內容

  1. 實測傳輸速率
  2. 上載網址
  3. 檔案上載
  4. 檔案下載
  5. 檔案管理
  6. 其他上下載方式
  7. 高品質頻寬及專線申請
  8. 服務窗口

目前建議使用上傳程式與實測傳輸速率

    1. 以 scp 的方式上傳檔案
      • YMU to NCHC 傳輸速率: 16.5 MB/s
      • SINICA to NCHC 傳輸速率: 23.8 MB/s
    2. 以 lftp 的方式上傳檔案
      • YMU to NCHC 傳輸速率: 14.2 MB/s
      • SINICA to NCHC 傳輸速率: 28.7 MB/s
    3. 快遞硬碟,請以下列檔案系統格式存放檔案
      • NTFS (WindowsNT, XP, 7, 8)
      • EXT2, EXT3, EXT4 (Linux)

上載網址

    1. 使用 cloud.st.nchc.tw,將會自動根據機器負載量挑選上載點
    2. 人工方式挑選上載點
      • 新竹上載點 IP: 140.110.16.169
      • 台中上載點 IP: 140.110.142.8

檔案上載

傳輸1G以上大檔案建議使用lftp,以免網速過慢時被中止

使用scp上載範例

 

請在 Linux 指令列下輸入以下指令

  1. $ scp ./chip_seq/my_raw_read_file my_account@cloud.st.nchc.tw:~/

  2. 指令說明:
    cloud1

  3. 輸入完成,按 Enter 後再輸入密碼,即可完成

 

使用lftp上載範例

請在改變路徑至檔案位置後,在 Linux 指令列下輸入以下指令

    1. $lftp -c "open -u my_account,password sftp://cloud.st.nchc.tw;mput -c my_raw_read_file"

    2. 指令說明

    3. upload

 

使用lftp上載整個資料夾
  • 把整個local_dir從上載到科學數據儲存系統的remote_dir,需要加上-R 。如要續傳不覆寫,可加上 -c 。

  • 指令:

    $lftp -c "open -u my_account,password sftp://cloud.st.nchc.tw; mirror -c -R local_dir remote_dir "

 

 

檔案下載

傳輸1G以上大檔案建議使用lftp,以免網速過慢時被中止

使用scp下載範例

 

    1. 請在 Linux 指令列下輸入以下指令

    2. $ scp my_account@cloud.st.nchc.tw:~/my_result_file ./

    3. 指令說明:

    cloud3

 

使用lftp下載範例

 

    1. 在 Linux 指令列下輸入以下指令

    2. $lftp -c "open -u my_account,password sftp://cloud.st.nchc.tw;mget -c my_result_file"

    3. 指令說明:

    cloud4

 

使用lftp下載整個資料夾

 

  1. 把整個remote_dir 從科學數據儲存系統下載到 local_dir 如要續傳不覆寫,可加上 -c。

  2. 指令:
    $lftp -c "open -u my_account,password sftp://cloud.st.nchc.tw; mirror -c remote_dir local_dir "

 

檔案管理

其他上下載方式

  1. Filezilla
  2. 請參閱: http://www.st.nchc.tw/gu_out_sftp.html

  3. 網頁介面
  4. http://www.st.nchc.tw/gu_out_wdav.html

  5. 圖形化介面

    http://www.st.nchc.tw/gu_out_sftp.html

     

高品質頻寬及專線申請

  1. 使用台灣高品質學術研究網路(TaiWan Advanced Research and Education Network, TWAREN)
    1. 請參考: http://noc.twaren.net/noc_2008/Services/LightPath_index.php
    2. 保證頻寬
    3. 目前針對學研單位尚無收費,但未來可能會傾向付費服務
  2. 使用TWAREN特提供專屬之Virtual Private LAN Service Network(VPLS)服務
    1. 請參考: http://noc.twaren.net/noc_2008/Services/VPLS/ApplicationNotice.php
    2. 在路由上調整,讓傳輸效益提高
    3. 目前尚無收費計畫

服務窗口

  • 黃介瑋
    • 1203019@nchc.narl.org.tw
    • (03) 5776085 分機 376
  • 王聿泰
    • yutaiwang@nchc.narl.org.tw
    • (03) 5776085 分機 384
  • 葉昌偉
    • terryyeh@nchc.narl.org.tw
    • (03) 5776085 分機 293
nrpb

生物小組

服務申請表

NGS網站